Garganta Profunda

Mulder e Scully vão para a base da Força Aérea em Ellens para investigar o caso misterioso de um piloto de testes militar que desapareceu depois de apresentar um comportamento estranho e psicótico.

Aperto

Um dos amigos de Scully, da época em que ela fazia a academia do FBI, pede sua ajuda na investigação de estranhos casos de assassinato, em que as vítimas tiveram seus fígados arrancados.

Conduíte

O caso de uma menina que desaparece do trailer onde mora com sua família faz com que Mulder acredite que ela tenha sido raptada por alienígenas, tal como aconteceu com sua irmã Samantha.

O Diabo de Jersey

Os agentes investigam a morte de Roger Crockett, um homem desabrigado, que foi atacado e devorado numa floresta.

Sombras

Mulder e Scully investigam estranhos assassinatos cometidos por uma força invisível que protege uma jovem.

Fantasma na Máquina

Um computador descontrolado começa a matar pessoas, para preservar sua própria existência.

Gelo

Mulder e Scully, juntamente com um pequeno grupo, ficam presos no Ártico depois das inesperadas mortes dos membros de uma equipe de pesquisadores que trabalhava na região.

Espaço

Mulder e Scully são contatados por um especialista em comunicações da NASA, que mostra para eles evidências de uma sabotagem em um programa espacial.

Anjo Caído

Uma nave não identificada cai na cidade de Townsend, Wisconsin, fazendo com que o governo coloque a área em quarentena.

Eva

Dos homens, cada um morando em um canto do país, são encontrados mortos no mesmo dia em seus quintais, sem nenhuma gota de sangue nos corpos.

Fogo

Mulder e Scully unem forças com um inspetor da Scotland Yard, quando um homem com poderes pirotécnicos assusta membros da aristocracia britânica.

Além do Mar

Scully acredita nas premonições psíquicas de um condenado à morte, que parecem ser a única esperança para que os agentes consigam prender um perigoso assassino.

Gênero Neutro

Um membro de uma seita religiosa capaz de mudar de sexo se torna o principal suspeito em uma onda de assassinatos.

Lázaro

O espírito de um perigoso criminoso se apossa de um agente do FBI, que já foi namorado de Scully.

Jovens no Coração

Um criminoso que teria morrido na prisão anos antes inicia uma vingança contra Mulder.

E.B.E.

Mulder e Scully se tornam o alvo de uma campanha de difamação quando tentam investigar o transporte secreto de uma forma de vida alienígena realizado pelo governo.

Homem do Milagre

Os agentes investigam uma paróquia liderada por um homem cujo filho possui o poder de curar - ou matar - com um simples toque de sua mão.

Formas

Os agentes procuram uma criatura semelhante a um lobo, descrita em uma lenda dos nativos americanos.

A Escuridão Cai

Um grupo de lenhadores trabalhando em uma floresta remota desenterra milhares de criaturas mortais semelhantes a insetos que paralisam suas vítimas e depois tecem seus casulos ao redor delas.

Tooms

Eugene Tooms, que Mulder ajudou a colocar na prisão, é libertado em condicional.

Nascido de Novo

Uma garotinha de oito anos é a principal suspeita de uma série de mortes bizarras e aparentemente não correlacionadas.

Roland

Quando importantes cientistas de um laboratório de pesquisas aeronáuticas morrem em circunstâncias misteriosas, os agentes suspeitam que um zelador mentalmente perturbado possa de alguma forma ser o culpado.

O Frasco Erlenmeyer

Garganta Profunda dá informações a Mulder sobre um caso extremamente importante que envolve um fugitivo desaparecido e a clonagem de vírus extraterrestres.